Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms