Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms