Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms