Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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UBQLN4Q9NRR5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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UBQLN4Q9NRR5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBQLN4Q9NRR5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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