Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms