Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSU72Q9NP77 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms