Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C11orf49Q9H6J7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms