Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NYXQ9GZU5 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms