Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ASXL3Q9C0F0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASXL3Q9C0F0 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms