Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIPCQ9C0C6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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