Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms