Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF6Q9BYE7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms