Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms