Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms