Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTA3Q9BTC8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTA3Q9BTC8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms