Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX2Q99697 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX2Q99697 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX2Q99697 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX2Q99697 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX2Q99697 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX2Q99697 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX2Q99697 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX2Q99697 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX2Q99697 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX2Q99697 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX2Q99697 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX2Q99697 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX2Q99697 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PITX2Q99697 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX2Q99697 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX2Q99697 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX2Q99697 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms