Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS8Q99627 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms