Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PKP4Q99569 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PKP4Q99569 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PKP4Q99569 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PKP4Q99569 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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PKP4Q99569 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PKP4Q99569 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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