Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CRBNQ96SW2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms