Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPR78Q96P69 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms