Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms