Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms