Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms