Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAMP4Q969E2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms