Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms