Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCG3Q8WXD2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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