Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC4Q8TBB5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC4Q8TBB5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC4Q8TBB5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC4Q8TBB5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC4Q8TBB5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC4Q8TBB5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC4Q8TBB5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC4Q8TBB5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC4Q8TBB5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC4Q8TBB5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC4Q8TBB5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC4Q8TBB5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC4Q8TBB5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC4Q8TBB5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHDC4Q8TBB5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHDC4Q8TBB5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHDC4Q8TBB5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC4Q8TBB5 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms