Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1N4

KRT78, Keratin, type II cytoskeletal 78, humanhuman

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT78Q8N1N4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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KRT78Q8N1N4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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KRT78Q8N1N4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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KRT78Q8N1N4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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KRT78Q8N1N4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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KRT78Q8N1N4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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KRT78Q8N1N4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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KRT78Q8N1N4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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