Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SYT9Q86SS6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYT9Q86SS6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYT9Q86SS6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYT9Q86SS6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SYT9Q86SS6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYT9Q86SS6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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SYT9Q86SS6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYT9Q86SS6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SYT9Q86SS6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYT9Q86SS6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SYT9Q86SS6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SYT9Q86SS6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYT9Q86SS6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYT9Q86SS6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SYT9Q86SS6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SYT9Q86SS6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SYT9Q86SS6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SYT9Q86SS6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYT9Q86SS6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYT9Q86SS6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYT9Q86SS6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYT9Q86SS6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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