Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q7L0L9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q7L0L9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q7L0L9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms