Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC12Q6PEW1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms