Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF6Q58WW2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms