Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms