Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM259Q4ZIN3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms