Protein–RNA interactions for Protein: Q4AE62

GTDC1, Glycosyltransferase-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTDC1Q4AE62 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTDC1Q4AE62 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms