Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF1Q3BBV0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms