Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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