Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM187BQ17R55 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms