Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDO1Q16878 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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