Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms