Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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