Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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