Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms