Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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