Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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