Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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SIX1Q15475 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SIX1Q15475 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SIX1Q15475 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SIX1Q15475 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SIX1Q15475 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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