Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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