Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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