Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms