Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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